广州分院为中科院机关派出机构，联系中科院在广东的南海海洋研究所、华南植物园、广州能源研究所、广州地球化学研究所、广州生物医药与健康研究院、深圳先进技术研究院、广州化学有限公司、广州电子技术有限公司，在湖南的亚热带农业生态研究所，在海南的深海科学与工程研究所。此外，依托广州分院的非法人单元有3个：广州中科院工业技术研究院、中科院云计算产业技术创新与育成中心、佛山中科院产业技术研究院。在建或筹建的国家重大科技基础设施项目4个，如中国散裂中子源工程、江门中微子实验项目等。

大洋电机（全称：中山大洋电机股份有限公司，股票代码：002249），坐落于南海之滨的广东省中山市，创办于2000年，是中国A股之上市公司，属广东省高新技术企业和百强民营企业，主要是微特电机及新能源电驱动系统的专业研发、制造及提供商。目前，建立了电动车辆国家工程实验室--大洋电机电驱动实验室和美国UL认证的电机实验室，拥有“省著名商标”和“省名牌产品”等自我品牌以及“国家火炬计划项目”、“省知识产权示范企业”、“省创新型企业”和“出口产品免验企业”等上百项荣誉。下辖主要机构及子公司包括：大洋电机新动力科技有限公司、湖北惠洋电器制造有限公司、大洋电机（香港）有限公司等18家控股及参股公司。